少年三国志零中，玩家可以围绕魏国五子良将、吴国弓手、蜀国轻骑、毒爆流、残暴流以及召唤流等核心思路来组建阵容。游戏内兵种分为重骑、轻骑、步、盾、弓、谋六种，存在克制关系，合理的阵容搭配能结合武将羁绊、兵种特性与军师技能，形成诸如以防御反击见长的魏国阵容、以后排爆发为核心的吴国阵容，或以高速突击为特点的骑兵阵容等多种流派。
魏国阵容以稳固著称，常以乐进、张辽、张郃、徐晃、于禁组成五子良将羁绊，能增加士兵数量提升承伤能力，搭配典韦、曹仁等盾兵武将构成坚实前排，军师可选择荀彧提供治疗和辅助。吴国阵容则擅长后排输出，核心武将包括制造灼烧的周瑜、提升弓手伤害的太史慈，以及甘宁、孙尚香、步练师等弓手，他们能在孙坚、程普、黄盖等武将提供的减速控制下，对处于异常状态的敌人造成暴击翻倍的伤害。蜀国阵容对平民玩家较为友好，核心思路包括以刘备的匡扶汉室技能为蜀国武将提供增益，搭配赵云、马超等轻骑兵快速切入敌方后排，以及黄舞蝶等弓手进行输出。
以特定状态效果为核心的阵容也颇具特色。毒爆流阵容依赖于贾诩、张郃、鲁肃等武将施加的中毒效果来针对敌方主将造成持续伤害。残暴流则以吕布、华雄为核心，强调高爆发的物理输出，擅长突破敌方前排阵型。召唤流则围绕张角、张宝等武将，通过召唤大量士兵形成人海战术，配合特定的羁绊效果来取得战场优势。这些阵容都需要相应的核心武将达到较高星级，并搭配合适的辅助与保护角色才能发挥威力。
游戏中的骑兵是一个重要兵种，可分为轻骑兵和重骑兵。轻骑兵流以马腾、马超、马云禄为核心，其特性是机动性强、不受远程压制，适合快速穿梭战场打击后排谋士和弓手，常与赵云、刘备等武将搭配。重骑兵则以吕布为代表，拥有强大的冲锋破阵能力。骑兵阵容需要讲究冲锋时机，并尽量避免与敌方的枪兵或高防御阵容正面交锋。
除了阵营和兵种流派，还有一些围绕单核武将构建的阵容。例如围绕周瑜构建的阵容，其核心在于最大化周瑜一技能灼烧的真实伤害，需要搭配张辽来提升灼烧伤害，并配置曹操、典韦等非常坚实的前排武将来拖住战斗回合，由军师诸葛亮来传播灼烧效果。以貂蝉为核心的谋士阵容，则可与吕布形成强力的控制与群攻组合，或搭配曹操、陆逊等武将来增强输出与生存能力。
玩家在组建阵容时，需根据已拥有的武将进行搭配，前期可优先培养易获取的核心武将，如首充赠送的赵云、系统赠送的刘备等。阵容并非一成不变，需要根据对手的布阵灵活调整站位与策略，例如使用骑兵针对敌方后排弓手为主的阵容。资源的分配应优先集中用于提升核心输出武将的星级与装备，以确保阵容的战斗力。
