火影忍者究极风暴4的战斗系统在继承系列核心玩法的基础上，进行了多方面的深化与优化，为玩家提供了兼具华丽演出与策略深度的格斗体验。其战斗机制围绕查克拉管理、形态切换与技能组合展开，保留了忍术、奥义等经典设定，同时强化了战斗的流畅性与视觉表现力。玩家在战斗中需要合理分配查克拉资源，用于释放强力忍术、发动终结性的奥义，或在关键时刻进入觉醒状态以扭转战局，这使得对战不仅仅是简单的招式对拼，更包含了资源管理与时机把握的策略考量。
本作中，奥义系统作为各角色的标志性必杀技得到了重点突出，其释放需要消耗查克拉，无法无限制使用，因此如何在对战中创造或抓住时机成功施放奥义，成为决定胜负的关键手之一。觉醒机制也更具特色，部分角色在满足条件后可以进入特殊的觉醒形态，不仅外观和招式发生变化，属性也会得到全面提升，部分修改器功能甚至展示了让角色保持觉醒状态常驻的设想，这从侧面印证了该系统在战斗中的重要性。这些改动使得角色性能差异更为明显，鼓励玩家钻研不同角色的打法特性。
游戏提供了多元化的模式来承载其战斗系统，满足了不同类型玩家的需求。故事模式高度还原了原著第四次忍界大战的剧情，让玩家在体验史诗篇章的同时进行战斗。冒险模式则允许玩家在忍者世界中自由探索，完成各种任务与挑战，并与其他角色互动以解锁新内容。对战模式支持本地与在线多人对战，是玩家之间检验技巧与战术组合的主要舞台。
除了直接的战斗对抗，游戏还内置了丰富的收集与成长元素。收藏模式允许玩家使用游戏内获得的金钱与忍宝，兑换包括服装模组、特殊语音在内的各种收集要素，增加了自定义与重复游玩的乐趣。成就系统则鼓励玩家通过战斗获取高水准的评价，从而解锁特定奖励，为追求极限操作的玩家提供了明确的挑战目标。
在战斗体验的细节层面，游戏通过技术升级带来了显著提升。战斗场景的破坏效果更为真实和夸张，查克拉爆发后的场面可以用天崩地裂来形容，增强了战斗的视觉冲击力与沉浸感。战斗动作的设计追求流畅与华丽，完美还原忍者的独特能力与高速对决的观感。整体战斗节奏经过调整，配合优化的操作反馈与打击感，力求让玩家在操控时感受到每一招每一式的力量与精准。
